Der berühmte schottische Architekt Robert Adam hielt diesen Tempel für eines der schönsten europäischen Bauwerke. Mit seinem rechteckigen Grundriss diente der Tempel der Verehrung des Jupiters. Er liegt auf einem erhöhten Podium, und vor dem Tempel stand ein Vorbau auf sechs Säulen. Das Gewölbe beeinflusste die frühe Renaissancearchitektur von Andrija Aleši und Nikola Firentinac in Trogir.
Die Umwandlung in das Baptisterium fand in der Spätantike statt, und unter dem Gebäude wurde eine Krypta errichtet, die dem hl. Tommy. Zu Beginn des 13. Jahrhunderts wurde in dem ehemaligen Gotteshaus ein Taufbecken errichtet, das aus einem Pluteus der Altarwand (11. Jahrhundert) besteht, die sich ursprünglich in der Kathedrale befand. Auf einer der Tafeln befindet sich die Darstellung eines kroatischen Königs (Petar Krešimir IV. oder Zvonimir), die früheste Darstellung eines europäischen Königs in einer mittelalterlichen Steinskulptur.
Heute wird das Baptisterium von der Jugendstilskulptur des heiligen Johannes des Täufers beherrscht, nach dem der Tempel nach der Umgestaltung benannt wurde, ein Werk von Ivan Meštrović, und davor steht eine der wenigen ganz oder teilweise erhaltenen Granitsphinxen, die Diokletian aus Ägypten mitbrachte. Das Taufbecken ist heute für Besucher zugänglich, die eine Eintrittskarte benötigen.
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